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　Windowsの標準ツールdiskpartでディスクを抹消可能とは知りませんでした。

http://www.atmarkit.co.jp/ait/articles/1004/16/news101.html


　概要は次の通り

管理者としてコマンド・プロンプトを実行

list disk でディスクを表示

select disk X でディスクを選択。Xにはディスクの番号を指定する

list disk で指定したディスクが選択されていることを確認

list partition でパーティション情報を確認

clean all で消去。0書き込み

list partition でパーティションが消えていることを確認

　起動ディスクを消したい場合には、インストールメディアからコマンドプロンプトを起動してコマンドを実行。